Isso não é uma forma de aumentar arrecadação com multas?

Não. O objetivo é melhorar a comunicação com o usuário: reunir as passagens em um só lugar e facilitar o pagamento da tarifa dentro do prazo. A tarifa de pedágio decorre do tráfego pela rodovia; o app CNH do Brasil apenas disponibiliza as informações para facilitar a identificação das passagens e orientar o pagamento. O período de regularização (Deliberação 277) existe justamente para evitar penalidades a quem paga em dia.